前者形状接近盾牌，较大；后者为椭圆形或椭圆形长方形，呈倒卵状，同比较小。前者的花色为乳黄色或黄白色；后者为浅粉色。前者果实为圆形、球形、橙色或黄色；后者为长椭圆形和暗黄色。
叶片差异
番木瓜叶片呈亚盾状，在茎顶部聚集，较大，直径约60厘米，长约60至100厘米。
木瓜叶片呈椭圆形或椭圆形，倒卵圆形，约5-8厘米长，3.5-5.5厘米宽，叶柄长约5-10mm（毫米）。
花色差异
番木瓜的花呈乳黄色或黄白色。
木瓜的花色为淡粉色。
果实差异
番木瓜果实呈椭圆形和球形，成熟时呈桔黄色或黄色，切果时种子不规则，大剂量种子。
木瓜果实呈长椭圆形和暗黄色，切后可包括5个房间，与前者比较显著。
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